しかし、二元論は学者には評判がよくありません（現在ではほぼ否定されているといってよい）。現代アメリカの哲学者であるダニエル・デネットは二元論を「デカルト劇場」と呼んで批判しています4(1)。
脳のなかにデカルト劇場という《社長室》があり、そこに“ホムンクルス5”という名の《社長》がいて、外部や身体内部からの情報を見たり聞いたりしている、というモデルです。それならホムンクルス《社長》の心はどうなっているのだ？と、議論はロシアの「マトリョーシカ人形」のように際限なく「その頭のなかはどうなっている？」と繰り返され、「無限後退」してしまうとデネットは批判します。
「脳とは別の実体」などは存在せず、心とは脳の神経細胞の活動そのものであるとの考え方が「心脳一元論」です。現代の心脳論の研究者（神経科学者、コンピュータ工学者、哲学者など）のうち大多数は一元論者といってよいでしょう。
意識の神経科学では、クリストフ・コッホとフランシス・クリック（DNAの二重らせん構造の発見者）が「意識に相関する神経活動（NCC:neural correlates of consciousness）」(2)を明らかにすれば、そこが『意識が局在する場所』」だと主張しています。視覚の研究ではNCCの解明が進んでいます。
視覚と意識の関係を研究しているフランスのスタニスラス・ドゥアンヌは、後頭葉に発した神経活動が前頭葉と頭頂葉の皮質に伝わり、大脳全体の細胞群（グローバル・ワークスペース）が同期して活動すると「視覚体験」という意識が生まれると述べています(3)。
痛みの知覚はペインマトリックスと「関連性が高い」ことはわかってきました。それでは、ペインマトリックスが痛みのNCCなのか？ あるいはペインマトリックスの神経活動を受けて「痛みを体験している」神経細胞（群）が別に存在しているのか？ デカルトの松果体説は神経科学の知見から見て、やはり誤りでした。
